Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06321 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06321 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P06321 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms