Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifnb1P01575 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifnb1P01575 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms