Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnkO88874 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnkO88874 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CcnkO88874 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CcnkO88874 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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