Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BlmO88700 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BlmO88700 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BlmO88700 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BlmO88700 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BlmO88700 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms