Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ClppO88696 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ClppO88696 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ClppO88696 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ClppO88696 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ClppO88696 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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