Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnmt3aO88508 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnmt3aO88508 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms