Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgceO70258 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgceO70258 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgceO70258 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SgceO70258 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgceO70258 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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