Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrna4O70174 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms