Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChkbO55229 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChkbO55229 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChkbO55229 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms