Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BckdkO55028 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BckdkO55028 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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BckdkO55028 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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