Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops5O35864 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms