Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RaxO35602 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RaxO35602 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RaxO35602 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RaxO35602 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RaxO35602 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RaxO35602 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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RaxO35602 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RaxO35602 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RaxO35602 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RaxO35602 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RaxO35602 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms