Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms