Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-ObO35424 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms