Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcc1O35379 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms