Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AlyrefO08583 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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