Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Bbip1J3QMK2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Bbip1J3QMK2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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