Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm21411J3KMS0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm21411J3KMS0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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