Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ScaperF8VQ70 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ScaperF8VQ70 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms