Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-M1F7CXU4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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