Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp988F6VKC7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms