Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Erich3F6QRE9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms