Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Defa27F2Z403 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms