Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
6030445D17RikE9Q8F9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms