Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf169E9Q7F2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf169E9Q7F2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms