Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC030500E9Q6W0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms