Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051665E9Q623 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BC051665E9Q623 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms