Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC005561E9Q5E2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC005561E9Q5E2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms