Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DspE9Q557 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DspE9Q557 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms