Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Hectd4E9Q2E4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms