Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3298E9PW80 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3298E9PW80 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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