Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm10110D3Z5M2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms