Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3543D3Z235 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm3543D3Z235 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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