Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clip3B9EHT4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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