Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cspp1B2RX88 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms