Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf518bB2RRE4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms