Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zbed5B2RPU8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zbed5B2RPU8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed5B2RPU8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms