Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spocd1B1ASB6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms