Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2c2A7L9Z8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms