Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4A4UUI3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms