Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Odf2A3KGV1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf2A3KGV1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms