Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b5A3FIN4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Atp8b5A3FIN4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms