Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CtcflA2APF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms