Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Frmpd4A2AFR3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms