Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc27A2A6Q5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc27A2A6Q5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms