Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Calcoco2A2A6M5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms