Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac6Q9Z2V5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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