Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl40Q9Z2Q5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl40Q9Z2Q5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms