Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubl3Q9Z2M6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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