Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms